聚类分析v1.2

光行资源网提供的聚类软件精简版是一款功能非常强大的物件等位基因频率分析工具，该软件功能齐全，可展开物件杂合度、信息内容成分等的分析测算，并可通过图形的方法表示测算屏幕，使客户更有力地进行科研工作聚类软件推测分析内容也非常多，例如欧式距离、多态性、基因遗传间隔、聚类算法就很方便推测。 需要的盆友快来免费下载这个软件吧。

聚类软件的最新版该软件实际操作方法简单，没有所有的难度系数，还有数据可视化的作用栏，客户可以方便地找到并应用所需的作用功能键。

聚类分析软件安装步骤

1、在本站下载一个名为聚类分析软件官方版的软件压缩包，解压后双击exe，进入安装界面，点击下一步2，设置软件安装位置建议安装在D驱动器上。 然后，下一步：单击3，选择持续文件夹，选择默认值即可。下一步( 4 )，选择是否创建软件快捷方式，然后下一步( 010 ) 集群分析软件官方版软件已安装，等待完成) 010-5550

1、安装完成后，单击打开桌面软件。 画面如图所示。 2，单击以定义矩阵。 这里可以控制数据的矩阵，定义数据矩阵的大小。 用“长宽”表示，x轴方向为品种，y轴为数据； 分类数(位点数)只需在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统的默认值为“1”。 输入“5”“4”“2”表示有5个品种，4行数据，2个基因位点。 系统最多支持255个品种、9999件数据。

3，输入数据，将分析数据文件导入软件进行分析，用定义的矩阵创建空白矩阵。 如果未定义矩阵大小，请使用当前矩阵的大小创建空白矩阵。 4，将数据归一化。 可以自动合成数据，并根据“标准差标准化”处理当前矩阵中的数据。 注：单击此命令可使用已处理的数据进行遗传距离计算和聚类计算。 在重新读取或查看原始数据后恢复原始数据，进行遗传距离和聚类计算时，将根据原始数据进行计算。 5、可以通过计算命令、鼠标点击不同的计算项目进行数据分析。 杂合度计算、多态性计算、欧氏距离计算、聚类计算6、数据显示与保存命令、原始数据显示、遗传距离显示、聚类图保存、矩阵保存、数据导出

聚类分析软件使用方法

一.如何定义矩阵？

1、运行软件，设置“矩阵定义”2、矩阵大小3，点击ok即可二。 如何查看集群分析软件官方版的帮助文件？

在集群分析软件官方版软件主页上点击“帮助”，可以快速查看帮助文件

聚类分析软件常见问题

1、定义矩阵

定义数据矩阵的大小，用“长宽”表示，x轴方向为品种，y轴为数据； 分类数(位点数)只需在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统的默认值为“1”。 输入“5”“4”“2”表示有5个品种，4行数据，2个基因位点。 系统最多支持255个品种、9999件数据。

2、输入数据

为每个定义的矩阵创建空白矩阵。 如果未定义矩阵大小，请使用当前矩阵的大小创建空白矩阵。

3、读取数据

当使用“保存矩阵”( save matrix )命令将存储在磁盘上的数据读入系统时，系统会自动创建适合其大小的矩阵，并读取所有数据。

4、添加数据

继续添加保存在当前矩阵末尾的数据，主要用于计算遗传距离。

5、读入遗传距离

可以读取保存在磁盘上的遗传距离数据，直接用于聚类计算。

6、数据规范化

按照《标准差标准化法》处理当前矩阵的数据。 注：单击此命令可使用已处理的数据进行遗传距离计算和聚类计算。 在重新读取或查看原始数据后恢复原始数据，进行遗传距离和聚类计算时，将根据原始数据进行计算。

7、计算杂合度

根据Nei公式( 1974 )计算各品种的杂合度。

8、计算多态性

用Nei公式( 1974 )计算各品种多态性信息含量。

9、计算欧氏距离

将各数据读入系统后，使用此命令根据Roger公式计算各品种之间的遗传距离。 注：如果“定义矩阵”未定义分类数(等位基因数)，则系统默认值为1。 在这种情况下计算的遗传距离与使用Mahalanobis公式计算的遗传距离相同。 不显示未注册用户的最后3个品种的遗传距离。

10、计算遗传距离

将各数据读入系统后，使用该命令可以根据Nei先生的公式( 1983 )计算出各品种间的遗传距离。 不显示未注册用户的最后3个品种的遗传距离。

11、进行聚类计算

在计算或读取遗传距离后，使用此命令根据P.H.A.Sneath等( 1973 )的类平均聚类法( UPGMA法，也称为非加权算术平均成对聚类法)进行系统聚类作为聚类结果，第1列的No是序列号，代表是第几次聚类； 第2列d是距离系数，第3、4列的breed1、breed2是参加聚类的2个品种，第5列的Cluster是聚类后的新名称，第6列的Content是2个品种的名称。 不显示未注册用户的最后三次群集结果。

12、查看原始数据

将原始数据读入当前矩阵。 清除标准化的数据。

13、调查遗传距离

在当前矩阵中显示读取的遗传距离或计算出的遗传距离。

14、查看聚类图

根据聚类结果自动绘制聚类图。

15、保存聚类图

将显示的群集图作为映像文件保存到磁盘。 未注册的用户没有这个功能。

16、保存矩阵

将当前矩阵保存到磁盘。 如果当前矩阵是原始数据，则保存原始数据； 如果是归一化后数据，则保存处理后的数据； 对于异质结度，保存异质结度； 如果是聚类结果，则保存聚类结果。 未注册的用户没有这个功能。

17、数据导出

系统会自动确定当前所有矩阵中包含的数据，并将其作为Excel文件导出。 未注册的用户没有这个功能。

软件作用

聚类分析软件是非常容易使用的物品等位基因频率分析工具！ 该软件具有物品杂合度、信息含量等强大功能，还可以用图形表示计算出的屏幕截图，方便用户进行更好的研究分析。 聚类分析软件可以计算分析的内容也非常多，如欧氏距离、多态性、遗传距离、聚类计算等，非常方便。 需要的朋友马上下载这个软件吧。 定义矩阵，输入数据