哈尔滨市内的黑龙江省传染病防治院为省级疫情定点医院，哈尔滨医科大学附属第一医院、哈尔滨市医科大学附属第二医院等4所医院为省级后备定点医院，除此之外还有哈尔滨市传染病院、哈尔滨市胸科医院两所市级定点医院和数十所区县级定点医院。
哈尔滨市疫情定点医院。
哈尔滨有一家省级定点医院，是黑龙江省传染病防治医院。有4家省级疫情备份定点医院，分别是医科大学第一附属医院、哈尔滨医科大学第二附属医院、哈尔滨医科大学第四附属医院、黑龙江省医院。
哈尔滨有两家市级定点医院，分别是哈尔滨市传染病医院和哈尔滨市胸科医院。区县两级定点医院包括哈尔滨市南岗区人民医院、哈尔滨市道里区人民医院、哈尔滨市道外区太平人民医院。
有平房区人民医院、哈尔滨市呼兰区第一人民医院、哈尔滨市阿城区人民医院、双城区人民医院、哈尔滨市巴彦县人民医院、哈尔滨市宾县人民医院和哈尔滨市方正县人民医院。
哈尔滨县级定点医院还包括通河县人民医院、武昌市人民医院、延寿人民医院、依兰县人民医院、木兰县人民医院、尚志市人民医院和哈尔滨市香坊区人民医院。
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